Серий 26
Развитие сюжета происходит в альтернативном Средневековье, где люди сражаются с ёма (яп. 妖魔 ё:ма), оборотнями, питающимися человеческим мясом. Съев мозги человека, чудовище способно завладеть его воспоминаниями. Кроме того ёма могут принимать облик своих жертв, таким образом скрываясь среди людей. Они намного сильнее и быстрее обычного человека, и противостоять им, даже используя оружие, практически невозможно — сверхъестественная сила ёма основана на использовании магической энергии, также именуемой «ёки».
С целью борьбы с ними тайная Организация создала группу могучих воинов, получивших прозвище «Клеймор» из-за своих огромных мечей. Все они — полулюди-полумонстры, выращенные из детей, в чьё тело были внедрены плоть и кровь ёма. Их сила и ум зачастую превосходят генный оригинал. Эти полукровки способны чувствовать потоки ёки и, таким образом, находить самих монстров. Все Клеймор за исключением 1го поколения — женщины. Они не стареют и могут умереть только насильственной смертью. Обычные люди побаиваются их, несмотря на то, что Клеймор запрещено убивать людей, и нарушение этого правила сурово наказывается.
Организация существует за счёт выполнения заказов различных городов на уничтожение ёма. Однако если тот или иной город отказывается оплатить работу, то Организация более с ним не сотрудничает, и ёма, обычно быстро узнающие об этом, уничтожают его.
Клеймор, также как и ёма, для сверхъестественных действий использует ёки. При частом использовании ёки человеческая природа Клеймор сходит на нет, и они становятся полноценным чудовищем, более сильным, умным и опасным, чем обычные ёма; это называется «пробуждение (яп. 覚醒 Какусэй)». Большинство Клеймор считают пробуждение хуже смерти и, чувствуя приближение этого момента, посылают одной из своих соратниц Чёрную карту — просьбу об умерщвлении, таким образом выбирая лучший для человечества вариант.
В главах манги, которые не охватил аниме-сериал 2007 года, выясняется, что мир намного больше, чем это казалось. Две державы — страны потомков драконов и страна, к которой принадлежит Организация, – ведут борьбу между собой. Остров, где происходили описанные до этого события, является лишь территорией для экспериментов Организации, создавших ёма, Клеймор, Порождение Бездны и других существ с целью вывести идеального воина.
