26-я серия: Возмездие
В Отдел поступила тревожная информация: в районе морского порта найдены тела двух убитых милиционеров и раненый пенсионер-автомобилист Хронов. Его доставили в больницу. Ранение оказалось серьезным, но он все-таки смог дать показания. Так оперативники узнали, что огонь открыл человек, вышедший из фуры.

27-я серия: Золотое дело
Сотрудники отдела ведут разработку банды, занимающейся контрабандой золота в особо крупных размерах. Стоимость незаконно вывезенного драгметалла — более восьмидесяти миллионов. Бухгалтер преступной группировки Баранов согласился оказать содействие, но дело осложнилось, когда был похищен глава синдиката Маркелов.

28-я серия: Погоня
После очередного неудачного покушения на депутата Воропаева, Настя, провожая его на вокзал, пыталась выяснить, кто же мстит ему, но Воропаев так и не смог очертить круг своих врагов. Правда, сотрудникам Отдела известны два имени причастных к преступлению людей: киллера — профессионала высокого класса, прошедшего подготовку в Пакистане, — и прямого заказчика — Куваева, владельца охранного агентства.

29-я серия: Ни живца
У советника полковника Сиротина украли ценные документы. Их необходимо вернуть через три дня. Спецотдел сразу насторожили обстоятельства исчезновения бумаг: из машины их вытащили явно борсеточники, но убийство шофера — не их почерк. Настя решила сама поговорить с Сиротиным, чтобы помочь ему вспомнить детали нападения.

30-я серия: Опасный груз
Все началось с убийства наркокурьера по кличке Финт. Его «наказали» за то, что он перебежал от наркодилера Гоги к Испанцу, отпускающему товар по более низкой цене. Быстро разобравшись с убийством «пешки», сотрудники Отдела поставили себе цель выяснить, каким образом в город попадают крупные партии героина.

5 сезон
1-я серия: Банда
Адвокат Нилов работает под прикрытием. По легенде он уже год как ушел из Отдела. Играет в казино, прожигает свою жизнь, и все ради поимки опаснейшего преступника. Однажды Нилова похищают вместе с владельцем казино. Их привозят в загородный дом, где с ними беседует матерый бандит Паша-Коломна. Адвокат не сразу понимает, зачем они понадобились бандитам и в какую игру они с ними играют, но когда в его руку вкладывают пистолет и приказывают убить товарища по несчастью, выбора у Нилова не остается.
2-я серия: Родная кровь
В городе происходят дерзкие ограбления. Бандиты подстерегают богатых клиентов банка в момент, когда те едут с большой суммой денег. Никто не может поймать банду. Оперативники силятся понять, как грабители получают информацию из банков. Чтобы выйти на след злоумышленников, спецотделу придется использовать все возможные средства, ведь начальство требует разобраться с этим делом в кратчайшие сроки.

3-я серия: Опасная рыбалка
Рано утром на озере рыбаки нашли труп бизнесмена Василенко. Известно, что неподалеку от этого места произошла разборка между наркоторговцами. Телевизионная журналистка связала два эти происшествия и выпустила непроверенные данные в эфир, ссылаясь на слова Скворцова. В спецотделе — скандал: новенький майор в первый же день работы повел себя непрофессионально.

4-я серия: Выход для героя
Трое бандитов захватили оружейный магазин, взяв в заложники покупателей и сотрудников. Они выдвинули требование — выпустить из Крестов их подельника по кличке Перелом, предоставить транспорт и возможность улететь заграницу. Генерал Шаламов отдал приказ выполнить требования бандитов. Но как только Перелом оказался на свободе, все вышло из-под контроля и у бандитов, и у спецслужб.

5-я серия: Цепная реакция
На глазах у Селина и Ухова погибает ученый Брусиловский. Оперативники находят в его машине документы государственной важности, которые не должны были покидать стен института. Кому собирался продать важные бумаги ученый и почему честный, порядочный человек Брусиловский пошел на преступление?

11-я серия: Юбилей
Спецотделу уже пять лет! Дружный коллектив собирается отпраздновать это событие, однако банкет приходится отложить из-за непредвиденного неприятного события. На этот раз тучи сгустились над Ниловым. Он подозревается в убийстве девушки, в квартире которой проснулся утром... Поздним вечером он помог ей избежать неприятностей на улице, и она пригласила его к себе.

12-я серия: Выгодный обмен
Неожиданная встреча Селина и Ухова с уголовником Петей «Колбасником» заканчивается погоней и трупом последнего. При нем обнаружена сумка с деньгами. Пока парни выясняют, кому и зачем потребовалась такая огромная сумма, у брата покойного Паши Апостолова сорвалась сделка крупной партии алмазов.

13-я серия: Золотая лихорадка
Происходит ограбление банка, в котором Антон Грошев безуспешно пытается взять кредит для покупки загородного дома. Грабители беспрепятственно выносят из здания золотые слитки и деньги, отключив сигнализацию. Основные подозреваемые в этом деле начальник смены охраны и главный инженер — мертвы. Нилов и Скворцов запомнили человека со шрамом, возможно киллера.

14-я серия: Вернуть за вознаграждение
Спецотдел подключен к расследованию смерти депутата Карташова, которая выглядит скорее случайностью, а не спланированным убийством. Это дело могло стать очередным «глухарем», если бы полковник Селин и подполковник Ухов не нашли и не спасли свидетеля этого трагического происшествия.

15-я серия: Должник
У миллионера Баринова похищают дочь. Дело поручено Спецотделу. Есть всего три дня на то, чтобы найти и спасти девочку. Одно непонятно: почему отец пропавшей не хочет получить помощь профессионалов, и что он скрывает от них?

16-я серия: Легкая добыча
Кошка, старинная приятельница Насти, упросила ее сходить вместе на лекцию по проблемам духовного роста и несовершенства мироустройства. Настя согласилась, хотя и была уверена, что это мероприятие не стоит внимания. Однако две подруги расположились в красивом зале особняка среди респектабельной публики.

6-я серия: Мародеры
Решившим отдохнуть коллегам из Спецотдела так и не удалось порыбачить. Ухов в лесу наткнулся на труп немецкого туриста, в руке которого были зажаты старинные золотые часы из давно утерянной коллекции. Вокруг трупа валялись каски немецких солдат времен Второй мировой войны. Все указывало на то, что это дело рук «черных копателей».

7-я серия: Подмена
Известный в криминальном мире игрок обратился к Алексею Нилову с просьбой вытащить его из лап оперов. А попал он в них «благодаря» игре в подпольном притоне «Белая лилия». На следующий день он решил пополнить свою кредитку и попался на том, что пытался положить на счет свой выигрыш, состоящий из… фальшивых тысячных купюр.

8-я серия: Панацея
Скоропостижно скончался заместитель министра здравоохранения. Мужчина умер прямо в бассейне. Друзья и коллеги — в недоумении: погибший производил впечатление абсолютно здорового человека. В тот же день в городе был убит кардиолог Панаев. Вскоре стало очевидно, что обе смерти — не случайны.

9-я серия: Бездорожье
Скворцов узнал от Олега Ловчева, своего инструктора по экстремальному вождению автомобиля, об угоне одного из их «навороченных» внедорожников, за рулем которого был инструктор Миша Михеев. Джип угнан, Михеев застрелен. На месте преступления была найдена целая куча обгоревших спичек и ни одного окурка.

10-я серия: Компромат
Со дня на день в Питере должен пройти воровской «сходняк», на котором предполагается назначить нового «смотрящего» по области. На эту должность рвется авторитет по кличке Крупа. Все это означает, что настало время передела собственности. Вызвано это убийством старого «смотрящего» — Хвоста.

7 сезон
1-я серия: Рейнджер
Бизнесмен Михайлов процветал. Но нашлись люди, которые захотели у него этот бизнес отнять. Естественно, подобру-поздорову Михайлов им этот бизнес отдавать не собирался. Тогда и случилась с ним беда: кто-то помог ему «спрыгнуть» с одиннадцатого этажа, а перед этим Михайлова пытали, о чем патологоанатому сказали следы на его теле.

2-я серия: Разводка
По личной просьбе Немчиновой сотрудники Спецотдела расследуют гибель Олега Яковлева, владельца известной арт-галереи. Он был найден мертвым около своего дома на водительском сидении собственного автомобиля. По заключению экспертов его смерть наступила в результате передозировки снотворного, и это — самоубийство.

3-я серия: Ловушка
После выхода очередного выпуска одной из «желтых» газет на журналистку Инну Борзову было совершено покушение. Все дело в той статье, которую она написала о «короле помоек» Нестерове. Также Борзовой удалось получить компрометирующее его фото, где он запечатлен с наркобароном Горелым.

4-я серия: Под ударом
Тяжелые времена пришли в Спецотдел! Генерал Шаламов оказался перед своей служебной дверью, опечатанной сотрудниками отдела Собственной безопасности наркоконтроля; через несколько минут на улице с елкой в руках в свой выходной день был задержан полковник Селин; Ухова и Грошева арестовали прямо на зимней турбазе, где они вели наблюдение за ее хозяином Григорием Гнедичем.

5-я серия: Торжество технологий
Убит адвокат Лещинский, свидетелей, как всегда, нет, зато подозреваемых — море... Партнер убитого Гонтмахер уверен, что с Лещинским разделался один из фигурантов трех самых скандальных дел, которые он выиграл совсем недавно. Подозреваются: директор кладбища Бугло, боксер Носов и бизнесмен Артур Карпович.

11-я серия: Попутное задание
В последнее время из разных поселков, расположенных на трассе Петербург-Мурманск, приходят известия об исчезновении молодых девушек. А несколько дней назад в интернете появилось жесткое порно с первой из пропавших — Мариной Кораблевой. Генерал Шаламов поручил Алексею узнать все о подобных «фильмах», а Ухова и Скворцова он отправил в садоводство «Хвойное», туда, откуда звонила последняя жертва.

12-я серия: Маска зла
«Маска зла». Храпову уже очень давно охота внедриться в игорный бизнес, особенно в игорно-паромный, но его туда не пускают — «ниша» занята. Тогда он сам решил расчистить себе «место под солнцем». Из Ростова от Миши Полтавы приехали два киллера, чтобы воплотить мечту Храпова.

13-я серия: Маска зла
Убит Михаил Рокотов — совладелец нефтеперегонного завода и сети автозаправочных станций. Орудием убийства стал баллончик с газом на основе цианида, обнаруженный в его автомобиле. Спустя совсем небольшое время поступило известие об убийстве вора в законе Саввы Саулова. Он был взорван в своей квартире вместе с охранником.

14-я серия: Мертвая вода
После того как недавно вышедший на свободу Клим не смог договориться с «авторитетным» Аракеловым, владельцем сети супермаркетов, о передаче ему половины бизнеса, произошло убийство. Аракелова расстреляли в упор из автомата. Перед этим на трассе людьми Клима был угнан грузовик Аркелова, перевозивший с Кавказа минеральную воду.

15-я серия: Находка
На берегу обнаружены два женских трупа. Удается установить, что обе девушки убиты из пистолета. Вскоре выясняется, что это пропавшие несколько месяцев назад Елена и Ирина. Происходит похищение 16-летнего подростка сын владельца агрохолдинга Саломатина.

21-я серия: Гамлет
Олег Иванович Данилов, крупный бизнесмен, перед тем как лечь в клинику, на собрании акционеров сделал важное объявление о том, что свою компанию он оставляет на попечение родного брата Сергея. А через пару минут прозвучал взрыв. У входа взорвалась машина Олега Данилова сразу же, как только он в нее сел.

22-я серия: Подарок отца
На Малой Пушкарской, в одном из питерских «колодцев», убит выстрелом в сердце полковник МВД Агапов, а за несколько дней до этого таким же способом был убит чиновник, глава администрации района Прилуцкий. На этом серия убийств не прекратилась — тяжело ранен выстрелом в грудь главврач больницы того же района.

23-я серия: Расплата
Убит авторитет Хохлов по кличке Хохол, известный еще с 90-х годов. В сгоревшем автомобиле найден его обуглившийся труп. Полгода назад он вернулся из мест заключения и поселился у своей старинной подруги Ольги в деревне, где они вместе выросли. И Спецотдел, и «коллеги» Хохла пытаются найти убийцу.

24-я серия: Телефон доверия
Настя, занимаясь статистикой звонков, сделанных на телефон Службы доверия МВД, обнаружила среди зафиксированных звонков один со стертой расшифровкой. По ее просьбе этим вопросом занялся Спецотдел... В пригороде Петербурга после завершения строительных работ в коттеджном поселке между бригадиром-гастарбайтером и хозяином дома Маховым вышел спор из-за оплаты.

25-я серия: Спецзаказ
Паша Ковалев — старый приятель генерала Шаламова обратился к нему за помощью. Ковалев после службы занялся бизнесом и владеет заводом по изготовлению высокоточных приборов. Недавно он получил выгодный заказ.